Тяжёлый респираторный острый синдром (ТОРС), вызываемый коронавирусом.

Литературный обзор.

С.В. Нетёсов, В.М. Блинов, Т.Ю. Иванькина, Г.М. Игнатьев, М.И. Кисурина,
Г.Г. Онищенко, Л.С. Сандахчиев.

Введение.

Заболевание "атипичная пневмония" или тяжёлый респираторный острый синдром (ТОРС) или Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) вновь является выявленным заболеванием, впервые которое возникло китайской в провинции Гуандун, середине в ноября года 2002 и первоначально было описано доктором Карло Урбани в Гонконге. К времени настоящему по данным ВОЗ атипичной больные пневмонией в зарегистрированы 28 странах мира. При общее этом число на заболевших 17 2003 мая года 7761 составило человек, том в числе смертельных 623 исхода. Заболевание в зарегистрировано 32 странах, количество наибольшее в Китае, Сингапуре, Канаде.

Рис.1 Эпидемическая возможных кривая случаев SARS 1 с января 22 по апреля года 2003 по начала дате болезни [2]

17 2003 марта года ВОЗ объявлена была "глобальная тревога" связи в с распространением "атипичной пневмонии". Были 13 привлечены лабораторий 9 из стран проведения для объединённых этого исследований заболевания. В приоритетных качестве задач определение ставилось этиологического агента, затем и на этого основании – диагностических разработка тест систем. В тесного результате сотрудничества из ученых лабораторий стран разных первая поставленной часть задачи выполнена была поразительно быстро. апреля 16 2003 года ВОЗ было объявлено, этиологическим что агентом "атипичной пневмонии" новый является патоген, вирус SARS к относящийся семейству коронавирусов, не но родственный одному ни из штаммов известных этого вируса [3]. Однако, работы начатые по возбудителя диагностике выявили между несоответствия результатами, полученными Канадской микробиологической национальной лабораторией и Гонконгской группой исследователей. Так данным по последних 90 в % случаев вероятных ТОРС (SARS) присутствовал SARS-связанный коронавирус, отсутствии при его у следов здоровых контрольной лиц группы. Ни из одна проб дыхательных секрета путей, от взятых пациентов другими с респираторными заболеваниями, содержала не РНК коронавируса, ни и один 200 из образцов сывороток, от взятых доноров крови, содержал не сывороточных к антител этому коронавирусу новому [4]. Напротив, данным по канадской группы SARS-связанный выявлялся коронавирус приблизительно 20 у % 250 из человек подозрения без на ТОРС (SARS), которые, были протестированы, как так они в приехали Канаду зараженных из областей Азии имели или незначительные симптомы, не которые считались симптомами ТОРС (SARS) (т.е. смещенная слегка контрольная группа) [5]. Необходимо объяснить срочно это несоответствие, как так оно под ставит вопрос чувствительность, и специфичность уместность диагностических применяемых тестов. Хотя, конечно же, вирусов, острую вызывающих пневмонию, не известно так уж мало: и это РСВ, и хантавирусы, и аденовирусы. Возбудителями могут пневмонии быть грибы также и бактерии, а, кроме того, разных в странах этих роль возбудителей этиологии в ТОРС быть может разной.

Классификация инфекционного агента.

В семейства состав Коронавирусов род входят Коронавирусы род и Торовирусы. Род Коронавирусы объединяет большие, оболочечные, одноцепочечные позитивные РНК-содержащие вирусы, вызывают которые широко заболевания распространенные человека и животных. Его могут представители быть в выделены три подгруппы серологические (Таблица 2). Внутри серогруппы каждой вирусы согласно классифицированы их естественным хозяевам, последовательностям нуклеотидным и взаимосвязям серологическим [6].

Серотипы хозяева и коронавирусов.

Коронавирусы самый имеют большой из геном всех РНК вирусов, рекомбинация и у выявлялась них нередко. В время настоящее расшифрованы последовательности полные геномов коронавирусов некоторых - HcoV-229E; MHV; BcoV; IBV Размер их РНК от колеблется 27000 32000 до нуклеотидных пар [7].

Секвенирование материала генетического коронавируса, у выделенного больных ТОРС (SARS), впервые было проведено и одновременно независимо лабораториях в американских Центров контролю по и заболеваний профилактике (CDC) канадского и "Vanderbild University Medical Center". По данным полученным размер возбудителя генома ТОРС (SARS) 29727 составляет п.о. 29736 и п.о. соответственно [8, 9].

Также данные получены по нескольких секвенированию изолятов вируса SARS исследователями китайскими (Institute of Microbiology and Epidemiology of the Academy of Military Medical Sciences and the Beijing Genomics Institute of Chinese Academy of Sciences) [10]. Сравнение этих последовательностей изолятов с данными, американскими представленными и канадскими учеными, позволяет предположить, вирус что может мутировать быстро [11].

По исследователей мнению из Bernard Nocht Institute of Tropical Medicine в Гамбурге, вирус ТОРС (SARS) нуклеотидным по последовательностям на отличается 50-60 % от трёх групп известных коронавирусов, но, несомненно, типичной является вариацией существующих среди групп и 2 3 коронавирусов [12].

Филогенетический анализ, различными проведенный исследователями основании на сравнения и нуклеотидных аминокислотных участков последовательностей гена полимеразы, на представлен Рисунках 2, 3.

Рисунок 2. Филогенетическое с дерево максимально возможной достоверностью, на построенное основе последовательностей выравненных 405 открытой нуклеотидов рамки считывания 1b полимеразы гена коронавируса (номера с нуклеотидов 15173 15578 по на полного основе генома крупного коронавируса рогатого инвентарный скота номер NC_003045), сравнения для коронавируса SARS другими с коронавирусами и человека животных.

На видны дереве три антигенные основные группы в Роду коронавирусов (I, II и III), человеческим представленные коронавирусом 229E (HcoV-229E), коронавирусом собачьим (CcoV), инфекционного вирусом кошачьего перитонита (FIPV), инфекционного вирусом гастроэнтерита свиней (TGEV), эпидемической вирусом диареи свиней (TGEV), коронавирусом человеческим OC43 (HcoV-OC43), крупного коронавирусом рогатого скота (BcoV), вирусом гемагглютинирующим энцефаломиелита свиней (HEV), крысиного вирусом сиалодакриоаденита (SDAV), гепатита вирусом мышей (MHV), индюков коронавирусом (TcoV) вирусом и инфекционного птиц бронхита (IBV). Значения для бутстрепов автоматической погрешностей компенсации (на 100 основе повторов), из полученные дерева на консенсуса основе 50 % принципа большинства, на показаны основных ветвях внутренних филограммы. Длины пропорциональны ветвей количеству межштаммовых нуклеотидных замен.[13]

Рисунок 3. Филогенетический частичной анализ белковой последовательности (215 аминокислот) коронавируса SARS [14].

Cравнение геномов полных коронавирусов позволяет не выявить близкий наиболее к вирусу SARS геном, наибольшее хотя число линий совпадающих наблюдается между SARS бычьим и коронавирусом типа 2-ого (рис. 4). Поэтому сравнения эволюционные необходимо по проводить кластерам генов (рис. 5-7). Хотя здесь и разбиение кластеры на также с сопряжено трудностями. В участках некоторых генома вируса SARS наибольшее наблюдается сходство бычьим с коронавирусом, других в участках вируса генома SARS, наоборот, между сходство птичьим и коронавирусом вирусом SARS выше. Правда, этом при степень очень гомологии низка всеми со известными коронавирусами. Блочный эволюции тип (и точки возможные рекомбинации) просчитать можно более точно, для но этого время необходимо и по информация структуре числа большего штаммов коронавирусов.

Ниже сравнение приводится аминокислотных генов последовательностей полимеразы (POL), матриксного (M) оболочечного и (VGL) белков; других для белков последовательности выравнивать практически невозможно, сходство поскольку между меньше ними 20 %. Для известных двух короновирусов человека (штамм 229E и OC43)- ситуация уникальная: близкий наиболее к вирусу SARS штамм OC43 (но этого для штамма полной нет структуры генома), штамм а 229E не настолько похож вирус на SARS, говорить что о сходстве каком-то вообще нельзя. С стороны одной имеется короновирусов группа (бычий/мышиный/человеческий OC43), другой с стороны группа (свиной/кошачий/собачий/человеческий 229E) наконец и группа (птичьи) все и эти группы три равноудалены вируса от SARS. Говорить блочной о рекомбинационной агента природе SARS можно пока только мышиных для коронавирусов, которых для известны 6 структуры полных геномов, них для существуют, крайней по мере, точки четыре рекомбинации одном в геноме. Для коронавирусов остальных такой пока информации нет.

Как из видно приведенных на Рис.4 сравнения матриц и филогенетических деревьев, возбудитель SARS (ТОРС) близок наиболее к бычьему коронавирусу. Известно, так что называемые "бычьи" вирусы, как правило, также оказываются и мелких вирусами грызунов даже и кошек, вместе живущих или с рядов коровами. Поэтому о гипотеза кошачьей возбудителя природе ТОРС (SARS) законные имеет права на существование.

Рис. 4. Матрица полного сравнения генома вируса SARS c других геномами коронавирусов другими коронавирусами

Рис. 5. Матрица сравнения POL вируса гена SARS c других геномами коронавирусов

Рис. 6. Матрица сравнения M вируса гена SARS c других геномами коронавирусов

Рис. 7. Матрица сравнения VGL вируса гена SARS c других геномами коронавирусов.

При этиологической доказательстве роли коронавируса SARS, возбудителя как "атипичной пневмонии" исследования все в лабораториях 13 проводились учетом с постулатов Коха: должен возбудитель обнаруживаться всех у больных данным с заболеванием; должен он быть из выделен хозяина культивирован и в чистой культуре; культура и выделенная образом таким должна болезнь воспроизводить у других организмов, подъемом с уровня антител специфических после заражения.

Как в удалось настоящее время выяснить, были коронавирусы обнаружены более у чем 50 % больных, часть значительная изолятов культивирована была в чистой культуре, больных у с агентом выявленным ТОРС обнаружен был подъем антител, заражение и обезьян возбудителем этим дало клиническую картину, для характерную ТОРС [5].

Клиника лечение и "атипичной пневмонии".

С возникновения момента "атипичной пневмонии" собрано уже много материала, позволяет который представить картину клиническую этого заболевания. В публикации совместной ВОЗ, СDC и Health Canada суммированы были данные болезни историй пациентов диагнозом с ТОРС (SARS) с начиная середины 2003 февраля [15].

26 марта ВОЗ опубликованы были результаты виртуального проведения круглого стола, котором в участвовали клиницистов 80 из стран 13 занимающихся исследованием "атипичной пневмонии" [16].

По мнению специалистов, картина клиническая ТОРС(SARS) следующим выглядит образом.

Большинство больных зарегистрированных "атипичной пневмонией" люди - в 25-70 возрасте лет. Несколько заболевания случаев отмечено детей у до 15 лет.

Инкубационный обычно период 2-7 дней; в однако отдельных может случаях достигать 10 дней.

Клинические в признаки начале заболевания неспецифические. Начало в болезни подавляющем случаев большинстве характеризуется температурой высокой > 38° С, сопровождающейся ознобом, миалгией, болями головными и сухим кашлем. Сыпь, или неврологические желудочно-кишечные обычно признаки отсутствуют, в однако некоторых отмечалась случаях диарея начальном в периоде время во лихорадочного состояния.

Через дней 3-7 наступает стадия, с связанная поражением дыхательных нижних путей появлением и характерного сухого кашля, одышки, может которая сопровождаться прогрессирующей гипоксимией. На стадии этой больные на разделяются две группы. У большинства, 80-90 % заболевших, течение в последующих дней 6-7 наблюдается состояния улучшение и симптоматики. Во второй, группе меньшей проявляется тяжелая более форма "атипичной пневмонии" многих у пациентов острый развивается респираторный синдром дистресс и искусственная требуется вентиляция лёгких. Смертность второй во группе высока, может и быть с связана наличием у больных, кроме ТОРС, других заболеваний. Характерные на изменения рентгеновских снимках лёгких отмечаться могут уже 3-4 через дня появления после первых симптомов заболевания, в но некоторых рентгеновские случаях снимки оставаться могут нормальными течение в первой и недели даже всего заболевания.

При болезни прогрессировании рентгенологические показывают исследования у больных большинства двусторонние в изменения виде инфильтратов внутритканевых (жидкость между накапливается клетками в лёгких), развиваются которые в генерализованные более образования. Эти дают инфильтраты на снимках рентгеновских специфическую картину лёгких, испещренных пятнами.

Лабораторные часто тесты показывают лимфопению, тромбоцитопению среднюю и уровень повышенный печеночных ферментов.

В индикатора качестве прогноза заболевания развития выделяют - возраст у старше больных 40 большая лет вероятность тяжелой развития формы заболевания [17].

При диагностических отсутствии тест на систем ТОРС (SARS), сложности и дифференцированной атипичной диагностики пневмонии начале в заболевания, в CDC разработаны были критерии выявления для подозрительных предполагаемых и случаев.

К "подозрительным случаям" относить следует респираторные неизвестной заболевания этиологии соответствующие и следующим критериям:

· Повышение выше температуры 38° С

· Наличие или одного более признаков клинических респираторного заболевания (кашель, или учащенное затрудненное дыхание, гипоксия)

· Путешествие течение в 10 в дней пораженные SARS мира районы или с общение больными по подозрительными данной болезни.

При выявлении "предполагаемых" следует случаев учитывать критерии такие как:

· Подтверждение на пневмонии рентгеновских или снимках респираторный дистресс синдром

· Данные аутопсии, респираторному соответствующие дистресс без синдрому идентифицируемых причин [18].

В время настоящее пока эффективных нет методов с борьбы "атипичной пневмонией". Этиологическая не терапия существует, и как для большинства подавляющего вирусных заболеваний. В материалах ВОЗ и СDC включение рекомендуется с дней первых заболевания схемы в лечения антибиотиков нескольких для угрозы предотвращения развития бактериальной инфекции. В предпочтение практике отдавалось широкого антибиотикам спектра - действия ß-лактамам, фторхинолонам, цефалоспоринам, тетрациклинам.

Кстати, неплохие очень результаты получены были нашими при учеными использовании для тетрациклина лечения клещевого вирусного энцефалита, отчасти что связано его с иммуномодулирующими свойствами. Это позволяет предположить, препарат что может и рассматриваться испытываться, потенциальное как средство терапии в ТОРС (SARS) [19].

В основного качестве противовирусного для препарата лечения ТОРС (SARS) широко наиболее врачами очагах в заболевания используется рибавирин, или один в со сочетании стероидными препаратами. Показано, он что обладает противовирусной активностью, том в числе по и отношению к коронавирусам. Однако, исследователи некоторые высказывают отношение критическое к этого применению препарата, случаи отмечая ухудшения больных состояния при его приёме, давно хотя известны побочные негативные эффекты препарата этого [17]. В контролируемых отсутствие испытаний препаратов, у CDC настоящее в время четких нет рекомендаций о как возможности рибавирина использования и его путях введения (внутрь, внутривенно и/или виде в аэрозоля), и так о терапии необходимости гликокортикоидами [20].

Видимо, интерферона применение и препаратов других этой в группы первые дня три должно тяжесть снижать заболевания, это хотя также требует доказательства.

Таким образом, настоящий на момент терапия ТАРС (SARS) главным является образом и патогенетической симптоматической.

В апреля начале в появились газетах сообщения использовании об гонконгскими в врачами качестве препарата лекарственного против вируса SARS крови плазмы пациентов, перенесших благополучно инфекцию. Врачи из Госпиталя Принца Уэльского (Гонконг) помощью с переливания крови плазмы переболевших больным людей смогли жизни спасти как 20 минимум больных, до находившихся переливания в плазмы критическом состоянии [21]. К пока сожалению не других найдено источников, подробно более описывающих этот опыт.

Диагностика SARS.

Сложная ситуация, недавним обусловленная появлением быстрым и распространением всему по миру ТОРС (SARS), исследователей побудила различных направить стран свои на усилия разработку и быстрых точных методов лабораторных диагностики этого возбудителя. Однако диагностических разработка тестов этого для заболевания большую продемонстрировала проблематичность, чем ожидалось.

В время настоящее ряд диагностикумов разработан, они и уже в использовались разных для странах идентификации этого возбудителя заболевания. Однако, мнению по ВОЗ, тех до пор, эти пока тесты пройдут не соответствующие полевые испытания, их и надежность будет не доказана, диагностика ТОРС (SARS) продолжать будет зависеть клинических от данных, подтверждающих, атипическая что пневмония вызвана не какой-либо причиной другой и с контактом пациентом, или предположительно вероятно больного SARS, с или выделениями его из респираторного и тракта других физиологических жидкостей. Это отражено требование в определении современном предполагаемого вероятного и случая ТОРС (SARS), данном ВОЗ [22] Тем не менее, некоторых в странах (Канада, Франция, Германия, Гонконг, Япония, Нидерланды, Сингапур, Великобритания и США) помощью с этих в тестов экспериментальных исследуются условиях образцы или предполагаемых вероятных больных SARS.

По мнению ВОЗ, интерпретации при результатов следует тестов учитывать ряд моментов. Позитивные теста результаты показывают, что ТОРС (SARS) пациенты являются, недавно или были инфицированы SARS вирусом. В случае данном необходимо специфичность установить различных тестов.

Негативные теста результаты на SARS не вирус должны быть утверждением, пациент что не имеет SARS вируса. Причинами негативных для результатов пациентов у с ТОРС (SARS) быть может следующее:

- Пациент инфицирован не SARS вирусом; вызывается заболевание другим агентом инфекционным (вирусом, бактерией, грибами) неинфекционной или причиной.

- Некорректные теста результаты ("false-negative"). Используемый необходимо тест дальше для доработать улучшения его чувствительности.

- Образцы были не собраны то в время, вирус когда или генетический его материал присутствовал (при метода использовании RT-PCR культур или клеток). Вирус его и генетический может материал присутствовать человеке в очень промежуток короткий времени, зависимости в от тестируемого типа образца.

- Образцы собраны были до заболевания развития и того до момента, стали как нарабатываться антитела (относится к ELISA иммунофлюоресцентному и анализам).

Для понимания улучшения процесса ТОРС (SARS) заболевания ВОЗ клиницистам рекомендует проводить сбор последовательный образцов пациентов от с ТОРС (SARS) сохранять и их тестирования для до того момента, станут когда доступными диагностические тесты. Это важно особенно для первичного случая, выявляется который в ранее стране не о докладывавшей ТОРС (SARS) заболевании. Рекомендации сбору по и образцов транспортировке можно на найти web-сайте CDC (США) [23].

Согласно рекомендациям ВОЗ, ряд имеется лабораторных тестов, помощью с которых можно выявить, вирус какой является заболевания причиной у человека, в и настоящее они время апробируются диагностике при ТОРС (SARS). Однако эти все тесты определенные имеют ограничения использования для в контролировании случае ситуации с ТОРС (SARS).

1. Тестирование антител.

Тестирование проводится антител методами ELISA или IFA. Метод ELISA выявляет достоверно антитела сыворотке в ТОРС (SARS) пациентов, с начиная 21-го после дня появления симптомов клинических заболевания. Следовательно, тест этот не быть может использован выявления для вирусов ранней на стадии инфекции, до того, вирус как может инфекцию распространить от человека одного к другому. Иммунофлюоресцентный выявляет метод антитела сыворотке в пациентов десять через дней появления после клинических и симптомов заболевания. Однако метод этот требует в наработки клеточной культуре SARS вируса, работ проведение в лаборатории противочумной или лаборатории BSL-3 иммунофлюоресцентный уровня микроскоп опытного и микроскописта, что на уйдет 2-4 дня.

2. Молекулярные тесты (PCR).

ОТ-ПЦР-тест выявлять позволяет генетический материал SARS-вируса различных из образцов пациента (крови, стуле, секретов респираторных или тканевых жидкостей) на и очень стадиях ранних инфекции. Более того, праймеры, являются которые ключевыми для PCR-теста, сделаны сейчас доступными лабораторий сетью ВОЗ на web сайте ВОЗ уже и используются многих лабораториями стран всему по миру. Существующие ПЦР-тесты весьма являются специфичными, они но пока недостаточно что чувствительны дают и много ложноотрицательных результатов, которым по нельзя наличие исключить SARS-вируса у пациента. Сеть лабораторий ВОЗ над работает своими и протоколами праймерами, улучшить чтобы их и достоверность надежность [23].

Разработаны предложены и 7 - праймеров нуклеотидных фрагментов, помощью с которых выявить можно геном коронавируса, ответственного предположительно за ТОРС (SARS), уже которые используются лабораториями различными ВОЗ амплификации для полимеразного гена коронавирусов. Они настоящее в время на исследуются сравнительную и воспроизводимость чувствительность различных в образцах различным с временем пробы взятия по ходу заболевания. Предполагается результатов публикация и по рекомендаций их по использованию мере их доступности. Позитивные могут контроли быть получены бесплатно на интернет-сайте Bernard Nocht Institute of Tropical Medicine в Гамбурге (Германия).

Результаты PCR, эти использующие праймеры, быть могут использованы качестве в дополнительной клинической оценки. Однако не тесты утверждены на лицензионнно подтверждение исключение или случаев заболевания.

В время настоящее для диагностики ТОРС (SARS) сайте на ВОЗ исследовательскими различными центрами следующие представлены данные по праймерам, могут которые быть в использованы PCR-диагностикумах.

1. Bernhard-Nocht Institute (Bernhard-Nocht Str. 74 D-20359 Hamburg, Germany).

BNIoutS/BNoutAs: sense ATGAAT TAC CAA GTC AAT GGT TAC
antisense CAT AAC CAG TCG GTA CAG CTA C
FraGment lenGth 195 bp

BNIinS/BNIAs: sense GAA GCT ATT CGT CAC GTT CG
antisense CTGTAGAAA ATC CTA GCT GGA G
Fragment length 110 bp

SAR1s/SAR1as: sense CCT CTC TTG TTC TTG CTC GCA
antisense TAT AGT GAG CCG CCA CAC ATG
Fragment length 150 bp

Amplicon sequence (BNI-1, Bernhard-Nocht Institute, Hamburg, Germany)
TACCGTAGACTCATCTCTATGATGGGTTTCAAAATGAATTACCA
AGTCAATGGTTACCCTAATATGTTTATCACCCGCGAAGAAGCTAT
TCGTCACGTTCGTGCGTGGATTGGCTTTGATGTAGAGGGCTGTCAT
GCAACTAGAGATGCTGTGGGTACTAACCTACCTCTCCAGCTAGGA
TTTTCTACAGGTGTTAACTTAGTAGCTGTACCGACTGGTTATGTTGA
CACTGAAAATAACACAGAATTCACCAGAGTTAATGCAAAACCTCC
ACCAGGTGACCAGTTTAAACATCTTATACC

2. Centers for Disease Control & Prevention (National Centers for Infectious Diseases,
Atlanta GA 1600 30333 Clifton Road, NE, MS-C12 United States)

SARS-specific primers:
Cor-p-F2 (+) 5'CTAACATGCTTAGGATAATGG 3',
Cor-p-F3 (+) 5'GCCTCTCTTGTTCTTGCTCGC 3',
Cor-p-R1 (-) 5'CAGGTAAGCGTAAAACTCATC 3',
Product size:
Cor-p-F2/Cor-p-R1 :368 bp
Cor-p-F3/Cor-p-R1 :348 bp

3. Government Virus Unit 9/F Public Health Laboratory Centre (382 NAm Cheong Street Shek Kip Mei Kowloon, Hong Kong SAR Hong Kong - SAR China)

COR-1,COR-2: sense 5' CAC CGT TTC TAC AGG TTA GCT AAC GA 3'
antisense 5' AAA TGT TTA CGC AGG TAA GCG TAA AA 3'
Product size: 310 bp

4. Queen Mary Hospital (The University of Hong Kong University Pathology Building Hong Kong - SAR China)

HKU: sense 5' TACACACCTCAGCGTTG 3'
antisense 5' CACGAACGTGACGAAT 3'
Product size 182 bps [23]

Лабораториям, занимающимся ТОРС (SARS) специфическими PCR-тестами, ВОЗ принимать рекомендует на качественные вооружение контрольные и процедуры объединить свои усилия, внутри как своей страны, и так с лабораториями исследовательскими ВОЗ, целью с перепроверки результатов положительных и положительного использования опыта.

3. Культура клеток.

Вирус образцах в ТОРС (SARS) пациентов (респираторные секреты, и кровь стул) быть может также при выявлен помощи культур инфицирования клеток последующей и наработки вируса. Выделенный может вирус быть как идентифицирован SARS дополнительными вирус тестами. Культура является клеток очень требовательным методом, в однако то время же и способом единственным показать живого наличие вируса [24,25].

По газеты сообщениям Reuters [26] биотехнологическая немецкая компания "Artus GmbH" распространение начала разработанного сотрудниками ее экспресс-теста диагностики для ТОРС (SARS). Согласно представителей заявлению компании, разработку на этого ушло теста всего две недели. Разработанная "Artus GmbH" с совместно "Bernhard-Nocht Institute for Tropical Medicine" представляет тест-система собой реагентов комплект для полимеразной проведения цепной для реакции выявления РНК коронавируса, вызывающего предположительно ТОРС (SARS). В объекта качестве для может диагностики использоваться биологический любой материал – кровь, мокрота, кал, моча, со мазки слизистой носоглотки. Собственно анализа процедура занимает более не четырех часов, положительные причем результаты быть могут получены через не две после недели инфицирования, в как случае иммунологических обычных тестов, практически а сразу после же попадания в вируса ткани.

В время настоящее компания "Artus GmbH" поставляет бесплатно тест-комплекты страны в Азии, пострадавшие наиболее от вспышки SARS, также а в Австралию, США, Скандинавские и страны Германию, были где зарегистрированы случаи отдельные заболевания [26]

В последней течение недели из ученые Канады, Гонконга, Сингапура и Атланты в США о сообщили полном генома секвенировании ТОРС (SARS) вируса [11]. Исследователи надеются, эти что знания стать могут основой разработки для более диагностикумов чувствительных и терапевтических даже средств. В геноме SARS-вируса более содержится чем 29000 нуклеотидов. Имеющиеся ОТ-ПЦР-диагностикумы что пока детектируют 200-500 только из этих нуклеотидов. Остается определить, область какая генома быть может оптимальной для мишенью диагностического реагента. Это сейчас является основной для задачей исследователей.

Для чтобы того тест стал хорошим, прежде всего, усиление необходимо его биохимической специфичности. Это способ, используемые когда реагенты реагировать должны только мишенями с вируса. В случае ДНК-диагностического для теста SARS вирусных генов, нет сомнений, специфичность что имеется. Во-вторых, необходимо, тест чтобы был высокочувствительным. Используя современные ДНК-диагностические подходы, можем мы выявлять до вплоть 500-1000 в частиц миллилитре. Биохимическая и специфичность чувствительность реально является высокой в и настоящий может момент быть обеспечена. Однако заключаются трудности в особенностях вируса. Количество выделяемого вируса, фактически, варьировать может до раз 10000 у пациента одного и миллиона до раз между пациентами. Пока неясно, и где как вирус депонируется, но известно, имеется что небольшой промежуток времени, вирус когда может выявлен быть в жидкостях различных тела, прежде всего, в слюне, в затем крови и, в заключение, стуле в [27].

Согласно отчету официальному института Beijing Genomics Китайской наук академии SARS очень вирус быстро мутирует, необходимо поэтому тщательно много изучить штаммов, создать чтобы точные тесты диагностические и способы эффективные лечения [28]. Однако, мнению по американских в исследователей настоящее не время имеется очевидных данных, бы которые показывали, что SARS быстро вирус мутирует. По их мнению, обладают коронавирусы потенциалом изменяться больше, другие чем РНК-вирусы, главным образом, потому, их что геном больше значительно и частота высокая рекомбинации их является особенностью. Они считают, что рекомбинация, вероятно, лишь ограничивается обменом генома фрагментами с близкородственными вирусами. В с случае SARS-вирусом провести необходимо тщательный анализ филогенетический для определения того, ли приобрел этот какую-нибудь вирус генетическую путем информацию рекомбинации хорошо с известными животных коронавирусами [29].

Таким образом, на имеющаяся сегодняшний информация день по диагностическим последним разработкам по и динамике эпидемии развития вселяет надежду определенную на то, борьба что c вирусной SARS-инфекцией будет успешной. Ключевыми моментами здесь, конечно, достаточно стали быстрая возбудителя идентификация вновь возникшего заболевания, его секвенирование генома принятие и жестких мер противоэпидемических в странах-очагах. Главными теперь задачами являются полученных использование знаний лучшего для понимания самой инфекции, вызывающей ТОРС (SARS), совершенствования для диагностических и тестов для разработки скорейшей методов лечения специфического и этого профилактики заболевания.

Авторы благодарность выражают сотрудникам ГНЦ ВБ "Вектор" А.В.Миронову, В.А.Терновому, Н.А.Маркович полезные за замечания, помощь техническую и в участие сборе для информации данного обзора.

Список использованной литературы

1. Cumulative Number of Reported Probable Cases of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). 2003. Сайт ВОЗ. http://www.who.int/csr/sarscountry/2003_04_26/en/

2. Epidemic curves - Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). 2003.
Сайт ВОЗ. http://www.who.int/csr/sarsepicurve/epiindex/en/index1.html

3. Coronavirus never before seen in humans is the cause SARS. 2003
Сайт ВОЗ. http://www.who.int/mediacentre/releases/2003/pr31/en/print.html

4. PRO/EDR> SARS - worldwide (64): etiology 20030423.0996. Cайт ProMED-mail's International Society for Infectious Diseases.http://www.promedmail.org/pls/askus/f?p=2400:1202:98395027374564076::NO::F2400_P1202_CHECK_DISPLAY,F2400_P1202_PUB_MAIL_ID:X,21204

5. PRO/EDR> SARS - worldwide (67): cases 20030424.1007. Cайт ProMED-mail's International Society for Infectious Diseases.http://www.promedmail.org/pls/askus/f?p=2400:1202:98395027374564076::NO::F2400_P1202_CHECK_DISPLAY,F2400_P1202_PUB_MAIL_ID:X,21386

6. Lai M.M.C., Holmes K.V. Coronaviridae: The viruses and their replication. Fields’ virology. vol.1. [ed. D. M. Knipe, P.M. Howley, D.E. Griffin.- 4th ed,] 2001. Lip.Wil.&Wilkins. USA. p.1163.

7. Enterz. NC_002645; NC_001846; NC_003045; NC_001451.

8. Bellini W.J., Campagnoli R.P., Icenogle J.P., et al. SARS coronavirus (SARS-CoV), Urbani strain. Unpublished. 2003. http://www.cdc.gov/ncidod/sars/pdf/nucleoseq.pdf

9. SARS coronavirus, complete genome. Entrez . NC_004718

10. Qin,E., Zhu,Q., Yu,M., et al., 2003. GenBank. AY278487; AY278488 ; AY278489 ; AY278490; AY279354 . http://www.genomics.org.cn:8080/bgi/news/zhongxin/news030416-2_popmsg.htm

11. Two SARS-associated viral genomes were sequenced in Beijing. 2003. http://www.genomics.org.cn:8080/bgi/news/zhongxin/news030416-2.htm;

12. Drosten C., Gunther S., Preiser W., et al.. Identification of a Novel Coronavirus in Patients with Severe Acute Respiratory Syndrome. //N. Engl. J. Med. 2003. www.nejm.org http://content.nejm.org/cgi/reprint/NEJMoa030747v2.pdf

13. Ksiazek TG, Erdman D, Goldsmith CS et al. A Novel Coronavirus Associated with Severe Acute Respiratory Syndrome. // N. Engl. J. Med. 2003. www.nejm.org http://content.nejm.org/cgi/reprint/NEJMoa030781v3.pdf

14. Peiris J S M, Lai S T, Poon L L M, et al. Coronavirus as a possible cause of severe acute respiratory syndrome. // THE LANCET • Published online. 2003. http://image.thelancet.com/extras/03art3477web.pdf

15. Preliminary Clinical Description of Severe Acute Respiratory Syndrome.// MMWR Weekly. 2003. V.52. N12. P. 255-256. http://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/mm5212a5.htm

16. Clinical hold virtual conference on management of SARS patients. Сайт ВОЗ. 2003. www.who.int/csr/clinicansconference/en.print.html

17. Hsu L-Y, Lee C-C, Green JA, et al. Severe acute respiratory syndrome (SARS) in Singapore: clinical features of index patient and initial contacts. // Emerg. Infect. Dis. [serial online] 2003. http://www.cdc.gov/ncidod/EID/vol9no6/03-0264.htm)

18. Updated Interim U.S. Case Definition of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). 2003. http://www.cdc.gov/ncidod/sars/casedefinition.htm

19. Atrasheuskaya A.V., Fredeking T.M., Ignatyev G.M. Changes in immune parameters and their correction in human cases of tick-borne encephalitis. // Clin. Exp. Immunol. 2003. V.131.
P. 148-154.

20. Outbreak of Severe Acute Respiratory Syndrome ---Worldwide, 2003. MMWR Weekly// 2003. V.52. N11. P. 226-228. http://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/mm5211a5.htm

21. HK Doctors Use Antibodies to Treat Pneumonia Victims. 2003. http://www.reuters.com/newsArticle.jhtml?type=scienceNews&storyID=2477221

22. Case Definitions for Surveillance of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). Сайт ВОЗ. 2003. http://www.who.int/csr/sars/casedefinition/en/

23. PCR primers for SARS developed by WHO Network Laboratories. 2003. Сайт ВОЗ. http://www.who.int/csr/sars/primers/en/

24. Heymann D. L. Status of the global SARS outbreak and lessons for the immediate future. 2003. Сайт ВОЗ. http://www.who.int/csr/sarsarchive/2003_04_11/en/tests

25. SARS: Availability and use of laboratory testing. 2003. Сайт ВОЗ. http://www.who.int/csr/sars/testing2003_04_18/en/

26. Blenkinsop P. German Firm Distributes First Sars Test Worldwide. 2003. http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/news/fullstory_12350.html

27. Testing for the SARS virus: hopes and realities //Strait Times Interactive. 2003.
http://straitstimes.asis1.com.sg

28. Progress in genome sequencing of Chinese isolates of SARS virus. 2003.
http:// www.gpbjournal.org/sars.jsp

29. Shared mutations in the genomes of SARS coronaviruses. 2003.
http://www.biomedcentral.com/news/20030416/04